菌落PCR怎麼做,菌落PCR的操作步驟及儀器有哪些?

2021-05-15 00:21:33 字數 1846 閱讀 4606

1樓:蠢羊羊

如果是革蘭氏陰性菌比如大腸桿菌還好,陽性菌幾乎不能成功,因為有很厚的胞壁沒法破壁。而陰性菌成功率也不是很高,就用牙籤在菌落上挑一點到pcr體系裡。但要考慮的是即使鑑定出轉化子後你怎麼儲存這個菌落?

再回板上找那個被挑過的殘存菌落嗎?與其這樣不如多花幾個小時搖菌液再pcr吧

2樓:匿名使用者

不是特別明白你所提出的問題, 能specific一點嗎?

根據我的理解, 你所說的是在做完transformation之後把接種的細菌塗盤, 其中理論上吞噬表達了目標質粒的細菌可以存活, 第二天當菌種長得肉眼可見的時候, 塗抹一點點用來做目標質粒的pcr, pcr成功的表明實驗成功, 請問你問的是這個問題嗎?

如果是假陽性不高, 基本上是一種用來快速screening的辦法, 就是篩選出很可能成功的菌落。 當然最後的**標準仍舊是miniprep之後做sequencing了。

做法就是統一配master mix, 也就是包含buffer, mgcl2, primer forward, primer reverse, ddntp, taq, 混勻後平均到pcr tube裡面, 之後每個菌落標號號碼, 用tip的尖稍微抹一點點就好了。 注意抹的時候要在本生燈下做, 要小心點避免汙染。 然後按照標號放pcr tube裡面。

之後pcr然後跑膠就ok了。

我在國外讀書, 學的都是英文的, 說的如果不太貼切或者是理解錯誤請見諒。

菌落pcr的操作步驟及儀器有哪些?

3樓:匿名使用者

1.取15-20ul tris-hcl 放到編好號的0.5ml 的ep管中

2.用滅菌牙籤,或槍頭,沾取少量菌體(多了效果不好)3.並將槍頭或牙籤在剛取出來的tris-hcl中涮一下,可以看到溶液略微變渾濁

4.蓋上管蓋,100c煮沸5-10min

5.離心,取1-2ul上清配製pcr反應體系。如果菌體較多,則取0.5ul就夠了

6.設定pcr儀程式,進行反應

7.結果電泳檢測即可

4樓:匿名使用者

菌落pcr要菌長的足夠大,一半搖菌儲存,另一半做pcr

菌斑一般用滅菌的槍頭在超淨臺挑取即可,在lb(搖菌用)和pcr反應液裡蘸一下即可。

反應液按正常反應體系加就可以,全程在冰上操作,加完後稍離心,然後設定好pcr儀的反應程式,進行反應。結果跑一下電泳即可。

5樓:阿扁床單

1.配置pcr反應體系,分裝於八連管中

2.在超淨臺裡用滅菌牙籤佔取少量菌體,將牙籤放在八連管液體中涮一下

3.設定pcr儀,進行反應

酵母菌落pcr怎麼做

6樓:北京索萊寶科技****

菌落pcr就是直接用懸浮的菌液作為pcr的模板加上primer dntp和酶 buffer直接搞pcr

pcr的條件要有所改變

我的經驗是把第一步的保溫時間延長到20min,可以破壞掉細胞.

然後迴圈的時間照舊.

(僅供參考)

菌落pcr和菌液pcr在原理和操作方面有什麼區別

7樓:匿名使用者

如果轉化成功的話,菌落裡的菌就含有你克隆的質粒載體了,用槍頭直接碰一下,然後作為pcr模板,就可以進行pcr擴增了。但是菌落pcr鑑定的假陽性率其實也不低,所以建議你挑取菌落擴培之後抽提質粒,進行酶切鑑定,這樣比較準確,酶切鑑定確認好之後再去測序以確定沒有鹼基突變或缺失。

你說的t7通用引物是指載體上的t7 promtor引物嗎?那只是一條引物啊,如果加上gbh下游引物的話,擴增出來的就是你連線進去的目的基因的長度了。

菌落PCR用在鑑定酵母整合gene的轉化子可信麼

因為加bai入過多的酵母細胞,反而抑制du了pcr反映的進行。後來用zhi dao5 dmso處理,結果很好,可以清楚地看內見兩條帶,和expression kit上面說容的也吻合 sali線性化his mut 佔大部分 10 14個測試菌落。萬分火急 轉化子的菌落pcr原理是什麼?如果轉化成功的話...

目的基因的擴增曲線,都怎麼看,定量pcr目的基因擴增曲線不好但是ct值很高怎麼回事

你好,擴增曲線可以粗略地判斷擴增效率。sybr green的雙delta ct法要求目的基因和內參的擴增效率基本一回 致。如果答不一致,需要對公式進行修正,部分qpcr儀的配套軟體可以做到,直接輸入每對引物的擴增效率。但無論如何,保證高擴增效率是實驗成功的關鍵。如果擴增效率一致,不同ct的曲線顯示出...

做PCR所要用到的緩衝液,這緩衝液指的是什麼

就是給pcr提供的一個最適酶催反應條件。不同公司的buffer緩衝液都是不一樣的,像離子濃度 ph等都有很大的差別。我們實驗室用的是諾唯讚的pcr酶,上次我好奇打了他們的技術 大概都有些kcl mgcl2 nh4 2so4 tris hcl等。希望對你有幫助!pcr中緩衝液和酶從冰箱取出後應有什麼操...