蛋白質組學研究不同組織蛋白質的差異常用那些技術或軟體

2021-03-27 20:44:21 字數 3217 閱讀 2595

1樓:匿名使用者

蛋白質組學常用的研究方法有2-d電泳和質譜技術,2-d電泳解析度較低,小分子和低電荷的蛋白不容易檢測,近年來常用的質譜技術maldi-tof-ms 和seldi-tof-ms技術。這兩種質譜技術常用的軟體有biomarker wizard version 3.1.

0 (ciphergen biosystems)和 protein biological system iic mass spectrometer reader (pbs iic, ciphergegn biosystems)。

蛋白質組學研究不同組織蛋白質的差異 常用那些技術或軟體?

2樓:匿名使用者

蛋白質組(proteome)的概念最先由marc wilkins提出,指由一個基因組或一個細胞、組織表達的所有蛋白質. 蛋白質組的概念與基因組的概念有許多差別,它隨著組織、甚至環境狀態的不同而改變. 在轉錄時,一個基因可以多種mrna形式剪接,並且,同一蛋白可能以許多形式進行翻譯後的修飾.

故一個蛋白質組不是一個基因組的直接產物,蛋白質組中蛋白質的數目有時可以超過基因組的數目. 蛋白質組學處於早期「發育」狀態,這個領域的專家否認它是單純的方法學,就像基因組學一樣,不是一個封閉的、概念化的穩定的知識體系,而是一個領域. 蛋白質組學集中於動態描述基因調節,對基因表達的蛋白質水平進行定量的測定,作為一門科學,蛋白質組研究並非從零開始,它是已有20多年曆史的蛋白質(多肽)譜和基因產物圖譜技術的一種延伸.

多肽圖譜依靠雙向電泳(two-dimensional gel electrophoresis, 2-de)和進一步的圖象分析;而基因產物圖譜依靠多種分離後的分析,如質譜技術、氨基酸組分分析等.

蛋白質組學研究內容

主要有兩方面,一是結構蛋白質組學,二是功能蛋白質組學。其研究前沿大致分為三個方面:

① 針對有關基因組或轉錄組資料庫的生物體或組織細胞,建立其蛋白質組或亞蛋白質組及其蛋白質組連鎖群,即組成性蛋白質組學。

② 以重要生命過程或人類重大疾病為物件,進行重要生理病理體系或過程的區域性蛋白質組或比較蛋白質組學。

③ 通過多種先進技術研究蛋白質之間的相互作用,繪製某個體系的蛋白,即相互作用蛋白質組學,又稱為「細胞圖譜」蛋白質組學。

蛋白質組學主要包括哪些分析技術及各自特點

3樓:安徽新華電腦專修學院

主要是看自己學對哪方面感興趣,比如電腦方面,發展的都是比較火熱的。僅代表個人意見!!!

蛋白質組學的研究手段有哪些

4樓:匿名使用者

比較多:最基本的

1、雙向電泳技術(理想目的:將細胞(或組織)內所有蛋白質都分離開來)2、質譜技術及一系列派生技術 (測蛋白質序列)3 、蛋白質互相作用研究:

酵母雙雜交,細菌雙雜交,免疫共沉澱技術,pull-down,fret,bifc等

4、蛋白質定位:

熒游標記技術,共聚焦熒光顯微鏡技術,免疫熒光,免疫化學等技術。

純化少量蛋白後如何濃縮

蛋白質分離純化過程中應注意哪些因素

論述蛋白質組學與基因組學的區別和聯絡

5樓:槐樹的戀愛

組學omics,研究的是整體. 按照分析目標不同主要分為基因組學,轉錄組學,蛋白質組學,代謝組學。

基因組學研究的主要是基因組dna,使用方法目前以二代測序為主,將基因組拆成小片段後再用生物資訊學演算法進行迭代組裝。當然這僅僅是第一步,隨後還有繁瑣的基因註釋等資料分析工作。

轉錄組學研究的是某個時間點的mrna總和,可以用晶片,也可以用測序。晶片是用已知的基因探針,測序則有可能發現新的mrna,

蛋白組學針對的是全體蛋白,組要以2d-gel和質譜為主,分為top-down和bottom-up分析方法。理念和基因組類似,將蛋白用特定的物料化學手段分解成小肽段,在通過質量反推蛋白序列,最後進行搜尋,標識已知未知的蛋白序列。

代謝組分析的代謝產物,是大分子和小分子的混合物,主要也是用液相和質譜。

總而言之,這些技術都想從全域性找變數,都是一種top-down的研究方法,原因很簡單:避免『只緣身在此山中』的尷尬。

但因為技術侷限,都各有缺點,尤其是轉錄組和蛋白組資料,基本上顛覆了以前一直認為的mrna水平能代表蛋白水平的觀念,因為這兩組資料的重合度太低。

所以目前很多研究都開始使用交叉驗證方法。

無論如何,都需要對資料進行分析,有經驗的分析往往能化腐朽為神奇。

蛋白質組學的研究意義和背景

6樓:忣純

雖然第一次提出蛋白質組概念

是在2023年,但相關研究可以追溯到上世紀90年代中期甚至更早,尤其是80年代初,在基因組計劃提出之前,就有人提出過類似的蛋白質組計劃,當時稱為human protein index計劃,旨在分析細胞內的所有蛋白質。但由於種種原因,這一計劃被擱淺。90年代初期,各種技術已比較成熟,在這樣的背景下,經過各國科學家的討論,才提出蛋白質組這一概念。

國際上蛋白質組研究進展十分迅速,不論基礎理論還是技術方法,都在不斷進步和完善。相當多種細胞的蛋白質組資料庫已經建立,相應的國際互聯**也層出不窮。2023年,澳大利亞建立了世界上第一個蛋白質組研究中心:

australia proteome analysis facility ( apaf )。丹麥、加拿大、日本也先後成立了蛋白質組研究中心。在美國,各大藥廠和公司在巨大財力的支援下,也紛紛加入蛋白質組的研究陣容。

去年在瑞士成立的geneprot公司,是由以蛋白質組資料庫「swissprot」 著稱的蛋白質組研究人員成立的,以應用蛋白質組技術開發新藥物靶標為目的,建立了配備有上百臺質譜儀的高通量技術平臺。而當年提出human protein index 的美國科學家normsn g. anderson也成立了類似的蛋白質組學公司,繼續其多年未實現的夢想。

2023年4月,在美國成立了國際人類蛋白質組研究組織(human proteome ***anization, hupo),隨後歐洲、亞太地區都成立了區域性蛋白質組研究組織,試圖通過合作的方式,融合各方面的力量,完**類蛋白質組計劃(human proteome project)。

什麼是蛋白質組學的基本技術流程

7樓:橋樑abc也懂生活

蛋白質組學的基本技術流程主要為以下四方面。 1 蛋白質標本的製備及分離:尋找較好的方法儘可能完全地抽提細胞或組織中的全部蛋白質是比較蛋白質組..

蛋白質組學檢測歸類於哪個行業,蛋白質組學的研究方向

生物化學,分析化學都有 如果提供技術檢測,當然屬於技術服務業。精準醫學為什麼只依賴於基因檢測,蛋白質組學,表觀遺傳學為什麼應用較少 答 幾個最關鍵原因,個人理解 基因檢測。最為成熟,週期快,成本下降飛快。最易於實現。中心法則。dna是遺傳資訊,理論可以提供最基礎的資料。蛋白質組學的研究方向 1.蛋白...

蛋白質電泳問題蛋白質電泳問題

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怎麼補充蛋白質,怎樣補充蛋白質?

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