高通量測序技術中的高通量是什麼意思

2021-05-29 00:00:44 字數 3773 閱讀 2428

1樓:夏維邇

高通量是相對於第一代測序的,第一代測序只能一次測1個樣品的1段序列,產生的資料量相對來說很小,而高通量測序一次能夠產生的資料量在幾十g上百g,可以一次測很多的樣本。

在2023年的時候,3700、megabace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。

不過到2023年以後,高通量測序就改指第二代測序(next generation sequencing),454、solexa(後改為illumina)和solid等第二代測序,比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序。

擴充套件資料

高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細緻全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deep sequencing)。

利用毛細管測序儀的轉變解決了凝膠板技術內在的通路追蹤問題,毛細管測序儀的自動化顯著提高了處理量,同時提供了更長的可測序長度。這些進展顯著增加了近些年產生的人類病原體的基因組資料。

當前主要的測序技術平臺,主要分為:

1、solexa測序技術(即大家耳熟能詳的illumina測序);

2、454測序技術(即焦磷酸測序技術);

3、solid測序技術(雙色編碼技術)。

總體而言,高通量測序技術的誕生可以說是基因組學研究領域一個具有里程碑意義的事件。該技術使得核酸測序的單鹼基成本與第一代測序技術相比急劇下降。

2樓:**ile我的愛人

打個比方,一代測序一次測序只能夠對1個基因進行測序,而高通量測序能夠一次檢測幾十甚至幾百個基因,這就是高通量,同時產生的資料也很巨大,一代測序一次測幾百bp,高通量測序一次測幾個gbp

高通量測序的意義

3樓:主流男生

高通量測序技術的誕生可以說是基因組學研究領域一個具有里程碑意義的事件。該技術使得核酸測序的單鹼基成本與第一代測序技術相比急劇下降, 以人類基因組測序為例, 上世紀末進行的人類基因組計劃花費 30 億美元解碼了人類生命密碼, 而第二代測序使得人類基因組測序已進入萬(美)元基因組時代。如此低廉的單鹼基測序成本使得我們可以實施更多物種的基因組計劃從而解密更多生物物種的基因組遺傳密碼。

同時在已完成基因組序列測定的物種中, 對該物種的其他品種進行大規模地全基因組重測序也成為了可能。

什麼是普通的基因測序,它和高通量測序有什麼區別嗎?

4樓:匿名使用者

「普通的基因測序」應該是指「常規dna測序」吧,是用sanger法(也就是雙脫氧法)進行測序的方法,目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 進行的自動測序,基本上可以做到600bp-800bp的讀長。

高通量測序的概念其實是一個相對的概念,在2023年的時候,3700、megabace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。

不過到2023年以後,高通量測序就改指第二代測序(next generation sequencing),454、solexa(後改為illumina)和solid等第二代測序,比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序。

ngs的特點主要有:

1、通量高,一個run能產生500mb-600gb的資料量

2、讀長相對較短,454(約400-500bp), illumina(100-250bp),solid(75-100)

3、單位資料的成本非常低,現在很多專案測序的費用,已經非常低,生物資訊分析成本變得更為重要了。

5樓:匿名使用者

高通量測序深度更深,覆蓋率更高。

奧拓基因是使用美國otoge***ics corporation的技術。公司產品重點是為科研和臨床檢驗提供新一代高通量測序產品和服務。本技術得到了美國國立衛生院創新技術**的支援,以及roche nimblegen和agilent的正式認可。

目前完全符合glp。奧拓已經處理了大量外顯子組樣本大規模的疾病和代謝基因組的高通量測序樣本,以及rna測序(rna-seq)樣本。通過為我們的服務或產品提供書面保證,對每個專案和客戶提供保證,我們已經建立了一個毋庸置疑的高質量的聲譽。

6樓:美吉生物

普通的基因測序即常規測序,高通量測序技術(

high-throughput sequencing)又稱「下一代」測序技術("next-generation" sequencing technology),以能一次並行對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定和一般讀長較短等為標誌。

高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變,一次對幾十萬到幾百萬條dna分子進行序列測定,因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變,同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細緻全貌的分析成為可能,所以又被稱為深度測序(deepsequencing)。

高通量測序中se,paired-end,pe,mp分別是什麼意思

7樓:澗shui藍

se是single-end 單端測序

pe是paired-end雙端測序

mp是mate-pair end也是雙端測序。

pe和mp的建庫方式有點不同:pe是dna直接打斷成200-500bp,雙端加引物接頭,測序。mp是dna先在2-10kb間選擇打斷大小,生物素標記成環,打斷成400-600bp片段,捕獲生物素標記片段,雙端加引物接頭,測序。

8樓:**ile我的愛人

就是單端測序,雙端測序,pe就是pair end,mp是多重擴增

什麼是普通的基因測序,它和高通量測序有什麼區別嗎

9樓:邂逅

「普通的基因測序」應該

是指「常規dna測序」吧,是用sanger法(也就是雙脫氧法)進行測序的方法,目前非常普遍的是直接用abi 3730xl 進行的自動測序,基本上可以做到600bp-800bp的讀長。

高通量測序的概念其實是一個相對的概念,在2023年的時候,3700、megabace等儀器上的測序也是高通量測序,是相對手工測序或者跑平板膠來說的。

不過到2023年以後,高通量測序就改指第二代測序(next generation sequencing),454、solexa(後改為illumina)和solid等第二代測序,比3730等第一代測序的通量提高了成千上萬倍,甚至上億倍,所以稱為高通量測序。

ngs的特點主要有:

1、通量高。一個run能產生500mb-600gb的資料量。

2、讀長相對較短。454(約400-500bp),llumina(100-250bp),solid(75-100)。

3、單位資料的成本非常低。現在很多專案測序的費用。已經非常低。生物資訊分析成本變得更為重要了。

高通量測序中中tags是什麼意思

10樓:匿名使用者

表面意思是指一個序列標籤,實際上是指一條read,就是測序儀讀取的一條序列。

高通量測序中深度和覆蓋度是什麼意思

11樓:**ile我的愛人

可以簡單理解為深度是一條鏈上一個鹼基檢測到的次數,覆蓋度是你檢測到的這個樣本的總鹼基數的百分比

高通量測序中cutoff是什麼意思

12樓:匿名使用者

相當於一個閾值,達到一定要求的標準,通常是會有一個cutoff值的。

三種高通量測序儀區別比較高通量測序技術ngs用什麼儀器

這些平臺中,只有ion torrent 是最新的半導體測序技術,2年來發展速度很快。因此如果要客觀評價的話,需要檢視更新的平臺比較的文章。推薦以下兩篇文章 a tale of three next generation sequencing platform parison of ion torre...

高通量基因測序與唐式篩查,nt檢查和高通量基因測序篩查什麼區別

問題分析 高通量基因測序產前篩查是一種無創產前篩查,比血清學篩查精準,缺點是比較貴。意見建議 建議你與你的產科大夫當面溝通,聽聽他的意見,瞭解高通量基因測序產前篩查的必要性。唐氏篩查高風險再查高通量基因測序產前篩查會不會更高 這麼給你bai說吧,普通唐du篩高風險可能 有60 的概率是二十一zhi三...

什麼是普通的基因測序,它和高通量測序有什麼區別嗎

佳學基因為你解答bai,根據du發展歷史 影響力 zhi測序原理和技術dao不同等,主要有以版下幾種 大 權規模平行簽名測序 massively parallel signature sequencing,mpss 聚合酶克隆 polony sequencing 454焦磷酸測序 454 pyros...