請問引物設計是用mRNA和其內部的CDS為都可以嗎

2021-03-03 21:30:07 字數 397 閱讀 7508

1樓:匿名使用者

mrna和cds的序列是一致的,只不過是rna和dna的u和t的區別。pcr是合成dna,當然是用cds了。cds是編專碼序列,染色體的屬dna是體內轉錄後剪下才表達,構建質粒的dna在體外細胞內培養剪下不了。

酶切位點的選擇是根據構建質粒所用的載體上的酶切位點,和cds上的酶切位點決定的。

原則是:1.選擇載體上位置相差不少於6個鹼基的兩個酶切位點,2.兩種酶要有最適緩衝液,

3.兩種酶不是同尾酶,即不能切相似的序列,4.兩種酶最好比較常用,這樣**不貴,容易買到,5.

最後也是非常重要的,要選擇目的基因即cds上沒有的酶切位點,這個可以在google搜尋web cutter 2.0這個網頁,輸入cds序列,檢視cds上的酶切位點,選擇可以使用的酶切位點。

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