SNP與InDel,生物中InDel詳細解釋

2021-04-17 22:07:43 字數 1643 閱讀 5917

1樓:浙大阿米巴

snp是單核苷酸多型性。

indel就是指insert或者deletion,插入或者缺失。

生物中indel詳細解釋

2樓:匿名使用者

insertion插入或deletion缺失如:插入:

生物原始基因序列:atcgtcgaatccggttg發生突變基因序列:atcgtcgaaatcgtccggttg,其中的小寫字母atcg為插入的序列,為插入突變;

缺失:生物原始基因序列:atcgtcgaatccggttg發生突變基因序列:atcgtcgaagttg,其中,原始序列裡的小寫字母tccg為缺失的序列,為缺失突變;

插入和缺失都相對於原始序列來說:缺失指,在原始序列中的某一段丟失;插入指,相對於原始序列在某個位置多了一段序列,即在這個位置插入了一段序列;

這樣可清楚?

怎麼**snp和indel對蛋白質序列的影響

3樓:泡泡魚兒曉

如果是鹼基對的復

插入(insert)、缺制失(deletion)(前二者合稱indel)是較為嚴重的突變,因為會造成移碼突變(frameshift),會導致插入或缺失位點後的所有鹼基順序錯位,因此此後氨基酸排佈會完全錯亂,從而導致整個蛋白質失去功能。

而替換(substitution)帶來的影響一般較小,如果替換後三聯體密碼子翻譯出來的氨基酸和原來的一樣(因為密碼子具有簡併性),那就沒什麼不同;而如果氨基酸發生了變化也僅僅是這一位點的氨基酸發生變化,不影響之後的氨基酸排序,所以影響也不會很大(但也不排除諸如鐮刀形貧血病這樣的單點突變造成的嚴重後果。)

重測序snp,indel,sv 統計資料怎麼分析

4樓:

比如說用primer3,你就把找到的包括這個snp的一段序列copy進去,在你的snp周圍用方括號包括一段序列,然後讓primer3設計就可以了

indel標記是什麼

5樓:匿名使用者

indel (insertion-deletion) 插入缺失bai標記,

指的是兩種du親本中在全基因組中的差zhi異,dao相對另一個親本而言,

版其中一個親本的權基因組中有一定數量的核苷酸插入或缺失(jander et al., 2002)。根據基因組中插入缺失位點,設計一些擴增這些插入缺失位點的pcr 引物,這就是indel 標記。

caps標記和indel標記的區別

6樓:大壞蛋

indel

(insertion-deletion) 插入缺失標記,指du的是兩zhi種親本dao中在內全基因組中的差異,容相對另一個親本而言,其中一個親本的基因組中有一定數量的核苷酸插入或缺失(jander et al., 2002)。根據基因組中插入缺失位點,設計一些擴增這些插入缺失位點的pcr 引物,這就是indel 標記。

caps標記:

基於snp的pcr技術與rflp技術結合的分子標記技術,簡單理解就是某snp恰好位於酶切位點上,通過對該snp位點設計引物,經pcr後獲得的相應產物片段經酶切、電泳等步驟,最終通過觀察不同的條帶判斷樣本的多型性。

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