基因組中refseq是什麼意思

2021-03-07 06:55:37 字數 1676 閱讀 3177

1樓:匿名使用者

就是參考序列。

ncbi 參考序列計劃提供了校正的序列資料和相關的資訊,給同行提供使用的標準。genbank是一個序列的儲存池,refseq資料庫將是一個參考序列的非冗餘集合,包括構建的基因組contig,mrna,蛋白,和,在未來,整個染色體。refseq記錄是有三種可以獲得的狀態:

**的,臨時的和檢查過的。檢查過的記錄代表了我們目前關於一個基因和它的轉錄子的知識的彙編。在檢查的過程中,我們整合了更多的資訊,只要是可以獲得,如序列資料,發表物,命名,和特徵註解,都來自於很多genbank記錄,人類基因組命名委員會,和omim。

最開始的refseq記錄版本包括人類mrna和蛋白參考序列。目前的範圍只侷限於人類序列

2樓:藍色葡萄風信子

refseq序列是ncbi篩選過的非冗餘資料庫,一般可信度比較高,是ncbi資料庫的參考序列

refseq 資 料 庫 是 ncbi 將 genbank 的 序 列 再 做 詳 細 整 理 的 non-redundent 序 列 資 料 庫 , 它 的 序 列 格 式 和 genbank 幾 乎 完 全 相 同 , 但 因 為 是 完 全 不 同 的 獨 立 資 料 庫 , 為 與 genbank 區 別 , refseq 的accession number 格 式 和 genbank 不 同 , 會 是 :

nt_123456 constructed genomic contigs

nm_123456 mrnas

np_123456 proteins

nc_123456 chromosome

假 使 得 到 的 output file 中 有 ref , 就 代 表 所 找 到 的 是 refseq 資 料 庫 的 序 列 :

ref|nm_00014|a2m| homo sapiens alpha-2-ma....

gi|4557284|ref|nm_00646.1|[4557284]

什麼是基因組序列

3樓:匿名使用者

人類基因組:指人體dna分子所攜帶的全部遺傳資訊。由24條雙鏈的dna分子組成(包括1~22號染色體dna與x、y染色體dna),上邊有30億個鹼基對,30多億個鹼基對構成的人類基因組精確測序,發現所有人類基因並搞清其在染色體上的位置,破譯人類全部遺傳資訊。

30億個鹼基對,太龐大了,無法精確的告知你序列是什麼樣的。但可以告訴你:人類基因組計劃:

1、概念:是指分析測定人類基因組的核苷酸序列。 2、主要內容:

繪製人類基因組的四張圖,即遺傳圖、物理圖、序列圖和轉錄圖。繪製這四張圖好比是建立一個「人體地圖」,沿著地圖中一個個路標,如「遺傳標記」、「物理標記」等,可以一步步地找到每一個基因,搞清楚每一個基因的核苷酸序列。 3、進展:

2023年6月26日,6國科學家向世界宣佈:「人類基因組草圖」的繪製工作已經全部完成。預計到2023年,「人類基因組精圖」的繪製工作也將全部完成。

4、意義:(1)對於各種疾病,尤其是各種遺傳病的診斷、**具有劃時代的意義;(有利於疾病的診斷和**。)(2)對於進一步瞭解基因表達的調控機制、細胞的生長、分化和個體發育的機制,以及生物的進化等也具有重要的意義;(有利於研究基因的表達和調控機制); (有利於研究生物的進化。

)(3)將推動生物高新技術的發展,併產生巨大的經濟效益。(有利於培育優良的動植物品種)。另外,美國奎格

基因組dna什麼意思,基因組DNA什麼意思

一樓的胡說八道,什麼是 基因的不知道還來亂回答。某細胞結構中的所有dna都可以稱為基因版組dna。比如細胞核中的全部 權dna就可以稱為核基因組dna,線粒體中的全部dna可以稱為線粒體基因組dna。一般說道基因組dna指的是核基因組dna,對於細菌就是擬核中的dna。dna鏈上有些是內含子 即不編...

單倍體基因組什麼意思,人的基因組幾條基因

基因組,genome,一般的定義是單倍體細胞中的 全套染色體為一個基因組,或是單倍體細內胞中容的全部基因為一個基因組.可是基因組測序的結果發現基因編碼序列只佔整個基因組序列的很小一部分.因此,基因組應該指單倍體細胞中包括編碼序列和非編碼序列在內的全部dna分子.說的更確切些,核基因組是單倍體細胞核內...

什麼叫低覆蓋度基因組測序,高通量基因組測序中,什麼是測序深度和覆蓋

不是覆蓋整個基因組的所有序列,而是覆蓋一部分,覆蓋率比較低,就叫低覆蓋度基因組測序 基因組測序中,什麼是測序深度和覆蓋度 測序深度是指bai測序資料對基因組du覆蓋深zhi度,如人類基因組有dao3g,我們測了過濾回得到clean data 90g資料量,那麼答測序深度是90 3 30x,覆蓋度是,...