什麼是轉錄組分析什麼是轉錄組測序分析中Unigene

2021-03-07 05:13:21 字數 1453 閱讀 7284

1樓:醉意撩人殤

轉錄組分析指對細胞內所有轉錄產物的集合的分析。

轉錄組(transcriptome)廣義上指某一生理條件下,細胞內所有轉錄產物的集合,包括信使rna、核糖體rna、轉運rna及非編碼rna;狹義上指所有mrna的集合。

轉錄組測序一般是對用多聚胸腺嘧啶(oligo-dt)進行親和純化的rna聚合酶ii轉錄生成的成熟mrna和ncrna進行高通量測序。

相對於傳統的晶片雜交平臺,轉錄組測序無需預先針對已知序列設計探針,即可對任意物種的整體轉錄活動進行檢測,提供更精確的數字化訊號,更高的檢測通量以及更廣泛的檢測範圍,是目前深入研究轉錄組複雜性的強大工具。

2樓:黑石礁畔

轉錄組是指某個物種或特定細胞在某一生理功能狀態下,細胞內所有轉錄的mrna產物的集合,包含了時間和空間的限定,是連線基因組遺傳資訊與生物功能的蛋白質組的必然紐帶。轉錄水平的調控是目前研究最多的,也是生物體最重要的調控方式。

應用高通量技術進行轉錄組測序是一種快捷可靠的獲取轉錄組資訊的方法。mrna的轉錄本表達分析,通過獲得研究物件基因組轉錄區域的資訊,鑑定轉錄發生位點,可變剪下等,其精確的計數方法更可對基因進行精確的定量分析。

3樓:七叔之家

轉錄組分析包括,編碼基因的分析,翻譯蛋白的**,外顯子內含子的剪下拼接,轉錄本的結構分析功能分析,二級結構等等,或者基因的差異表達

什麼是轉錄組測序分析中unigene

4樓:

簡單地說,bai 高通量測序時du,在晶片上的每個反zhi

應,會讀dao出一條序列,是比較短專的,叫read,它們屬是原始資料; 有很多reads通過片段重疊,能夠組裝成一個更大的片段,稱為contig; 多個contigs通過片段重疊,組成一個更長的scaffold; 一個contig被組

外顯子捕獲測序和轉錄組測序分析有什麼不同

5樓:匿名使用者

答:外顯子捕獲測序和轉錄組測序都是針對基因組上轉錄區域進行測序,但是外顯子捕獲測序針對已有基因組資訊的物種,而轉錄組分析既能針對已有基因組資訊的物種,也能針對沒有基因組資訊的新物種,因此,兩者的分析存在一定的差異:

(1)分析的目標區域有所不同。外顯子捕獲測序只針對基因組上已知的編碼區,而轉錄組測序不僅針對基因組上已知的編碼區,還能夠檢測非編碼rna等轉錄組的資訊。

(2) 分析的手段所有不同。外顯子捕獲測序只需要把測序結果比對基因組,分析序列差異。轉錄組測序既可以把測序結果比對基因組,也可以進行從頭(de novo)拼接。

(3) 得到的結果有所不同。外顯子捕獲測序可以得到序列變異的資訊,而轉錄組測序不僅可以獲得已知序列的變異資訊和新的轉錄本資訊(針對從頭拼接),還可以得到表達譜資訊。除此以外,轉錄組測序還能夠分析mrna的可變剪接,而外顯子捕獲測序的樣品**是基因組,不能夠進行mrna的可變剪接分析,只能夠得到外顯子上的序列變化。

什麼是正二測,什麼是正二測?

正二複測 將形體放置成使它的制三條坐bai標軸與軸測投影面具有相 du同的 約 zhi35 16 夾角,然後向軸測dao投影面作正投影。用這種方法作出的軸測圖稱為正等軸測圖。按獲得軸測投影的投射方向對軸測投影面的相對位置不同,軸測投影可分為兩大類 正軸測投影和斜軸測投影 正軸測投影又分為 1 正等軸...

生物中什麼是實驗組,什麼是對照組

通常,一個實驗總分為實驗組和對照組。一般來說,實驗組是接受實驗變數處理的物件組 對照組對實驗假設而言,是不接受實驗變數處理的物件組。兩者不是絕對的,實驗組和對照組是相對而言的。通過設定實驗組和對照組,從理論上說,由於實驗組和對照組的無關變數的影響是相等的,被平衡了,所以實驗組和對照組兩者的差異,則可...

CPI CPII CPIII是測什麼的

高速鐵路工程測量平面控制網分四級佈設,分別是cpo cpi cpii cpiii。1 cpo是框架控制網,採用衛星定位測量方法建立的三維控制網,作為全線 段 的座標起算基準。2 cpi是基礎平面控制網,主要為勘測 施工 運營維護提供座標基準,採用衛星定位測量方法進行測量。3 cpii是線路平面控制網...