全基因組測序100k可以檢測出平衡易位嗎

2021-03-03 20:27:38 字數 1740 閱讀 3893

1樓:匿名使用者

個人基因組測序首先可以知道自己的基因組序列

全基因組測序可以檢測出平衡易位嗎

2樓:匿名使用者

平衡易位用核型分析就可以檢測了,目前的基因晶片技術還不能檢測平衡易位。

3樓:滴答滴答雨

人家問得是全基因組測序你們說晶片幹啥?全基因組測序通過特別的策略可以分辨平衡易位,但是成功率低,不穩定,還在科研沒有用於臨床。

4樓:司朋令狐天睿

全基因測序檢測檢測不出平衡移位,全基因測序只能得到一大批無用的資料。這些資料有什麼用,需要基因解碼,這個需要找佳學基因。

高通量測序可以檢測染色體平衡易位嗎

5樓:楓葉綠了

染色體易位是在卵細胞受精後,小孩出生前發生的。如果按小孩出生日期算就是先天的。但染色體是否有易位可以在懷孕後檢查出來。如果有易位,醫生會讓家屬選擇是否繼續生這個小孩。

全基因組測序資料獲取後應該怎麼分析

6樓:匿名使用者

巨集基因組是指特定環境中全部生物(微生物)遺傳物質的總和。巨集基因組測序是利用高通量測序技術對環境樣品中全部微生物的基因組進行測定,以獲得單個樣品的飽和資料量,可進行微生物群體的基因組成及功能註釋,微生物群體的物種分類,多樣性分析,群落結構分析,樣品間的物種或基因差異以及物種間的代謝網路研究,探索微生物與環境及宿主之間的關係,發掘和研究新的具有特定功能的基因等。與傳統方法相比,基於高通量測序的巨集基因組研究無需構建克隆文庫,這避免了文庫構建過程中利用宿主菌對樣品進行克隆而引起的系統偏差,簡化了實驗操作,提高了測序效率。

此外,巨集基因組測序研究擺脫了微生物分離純培養的限制,擴充套件了微生物資源的利用空間,為環境微生物群落的研究提供了有效工具。通過巨集基因組深度測序可以揭示或估計環境中真實的物種多樣性和遺傳多樣性,挖掘具有應用價值的基因資源,應用於開發新的微生物活性物質,為研究和開發新的微生物活性物質提供有力支援。技術流程生物資訊分析1.

原始資料整理、過濾及質量評估2.基於物種丰度分析:?物種丰度列表?

稀釋曲線3.基於物種丰度分析:?丰度分佈曲線圖?

生物多樣性指數(α多樣性)列表?物種丰度差異性分析列表?多樣品物種分佈柱圖?

丰度差異物種聚類分析?pca圖?krona圖4.

基因丰度列表:?提取基因分級註釋丰度列表(ko、nog、subsystem)?功能基因列表?

生成venn圖?基因丰度差異性分析列表?丰度差異基因聚類分析?

富集分析(ko)樣品要求1、樣品採集:樣品採集條件的一致是最為重要的環節,嚴格按照取樣標準取樣,取樣後立即封存樣品冷凍儲存。2、樣品dna:

環境因素異常複雜,許多物質或抑制因子影響後續pcr、測序文庫構建和序列測定,常規提取方法不一定適合,建議採用專用試劑盒提取。dna濃度≥20ng/μl,總量≥6μg(熒光定量),並確保電泳檢測無明顯rna條帶,基因組條帶清晰、完整;基因組dna完全無降解;提供dna電泳檢測**,用自封袋密封后隨樣品一起送樣;組織樣品>1.5g。

3、樣品儲存期間切忌反覆凍融。4、送樣管務必標清樣品編號,管口使用parafilm膜密封。

全基因組測序的意義是什麼?

7樓:匿名使用者

個人基因組測序首先可以知道自己的基因組序列,中源協和對比到正常基因組上可以檢視是否存在突變與異常,能夠檢測出基因是否異常,會否導致疾病等,**疾病風險,價值很大的。

全基因組測序的測序應用,全基因組測序的意義是什麼

通過生物信bai息手段,分析不同du個體基因組zhi間的結構差異,同時完成daosnp及基因組結構註釋。回 dna突變可答誘發癌症。吸菸過程中所釋放的 60種致癌化學物質可與dna結合並對dna鏈上的鳥嘌呤和腺嘌呤進行化學修飾從而產生大的加合物,該加合物改變了dna雙螺旋的結構,如果不被核苷酸剪下修...

什麼叫低覆蓋度基因組測序,高通量基因組測序中,什麼是測序深度和覆蓋

不是覆蓋整個基因組的所有序列,而是覆蓋一部分,覆蓋率比較低,就叫低覆蓋度基因組測序 基因組測序中,什麼是測序深度和覆蓋度 測序深度是指bai測序資料對基因組du覆蓋深zhi度,如人類基因組有dao3g,我們測了過濾回得到clean data 90g資料量,那麼答測序深度是90 3 30x,覆蓋度是,...

RNA測序與整個基因組測序相比有什麼優勢

朋友你好!雖然rna種類多樣,但我們拿來測序的一般是信使rna即mrna。眾所周知mrna是核內基因表達時通過轉錄修飾後的產物,其直接通過招募核糖體結合trna進行翻譯表達。因此相比於dna,mrna上既沒有複雜龐大的非表達dna部分 這類dna元件不會轉錄出mrna 也不含內含子等表達基因的冗餘部...